云南哈尼梯田当前栽培水稻ALK基因的遗传多样性及与稻米糊化温度的关联分析

摘要：

云南是世界公认的亚洲栽培稻遗传多样性和起源中心之一.利用51对SSR分子标记对云南哈尼梯田当前栽培的111份水稻材料进行多态性检测,并分析其群体结构.聚类分析表明,供试材料主要分为偏粳类群(group I)及偏籼类群(group II)两大类群,其中以偏籼类群居多,占83%,这两类群并未完全按地理来源聚类.所选材料稻米的糊化温度变异较广,可以分为低(<66℃)、中低(66~70℃)、中高(70~74℃)和高(>74℃)4类.通过基因测序,分析了稻米糊化温度控制基因ALK的序列多样性,发现其可以分为10种单倍型.关联分析结果表明,所选水稻样品稻米的糊化温度主要由ALK基因3个SNP位点组合控制.其中,A-GC和G-TT两种组合主要控制低(<66℃)和中低(66~70℃)糊化温度,G-GC组合主要控制中高(70~74℃)和高(>74℃)糊化温度.SNP3402 T类型与高、中高糊化温度有关.绝大多数偏籼类品种的ALK基因含有G-GC组合,因此都倾向于高糊化温度.上述研究结果为水稻分子育种和种质资源保护研究提供了一定的参考价值.

关键词：水稻、ALK基因、遗传多样性、哈尼梯田、糊化温度

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分类号：S51;F59

资助基金：国家重点基础研究发展计划项目2013CBA01402;国家自然科学基金项目31561143008,31300324;江苏省高校自然科学研究面上项目13KJB180028资助.This study was supported by the National Basic Research Program of China2013CBA01402;the National Natural Science Foundation of China31561143008, 31300324;the Natural Sciences Research Project of Higher Learning Institution in Jiangsu Province13KJB180028

在线出版日期：2017-04-06（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共11页

页码：343-353