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10.3724/SP.J.1006.2016.00795

小麦全基因组NBS类R基因分析及2AL染色体NBS-SSR特异标记开发

引用
NBS (nucleotide binding site)类基因是植物界中最重要的一类抗病基因。用信息学方法从普通小麦(Triticum aestivum L.)全基因组中分离出2406条含有NBS结构的完整蛋白序列,每条包含48~2272个氨基酸残基。根据NBS结构域两端是否连接CC或LRR结构域,将TaNBS分为N、CN、NL和CNL 4类。对TaNBS所在scaffold序列的SSR位点进行诊断,从1203条scaffold序列上发现2177个SSR位点,以二碱基重复位点最多,占73.5%。针对小麦2AL染色体上的51个SSR位点开发标记,缺体–四体和双端体验证结果表明,有39个标记(76.5%)为2AL特异标记,其中24个特异标记在抗白粉病材料Khapli (2AL上携带Pm4a)和感病材料Chancellor间存在多态性。利用近等基因系Khapli/8*Cc筛选出3个可能与Pm4a连锁的NBS-SSR标记,分别是Sxaas_2AL22、Sxaas_2AL39和Sxaas_2AL46。本研究开发的与抗病序列紧密连锁的特异SSR标记可用于2AL染色体上抗病新基因的检测以及已有抗病基因的候选序列筛选。

小麦、抗病、NBS类基因、SSR标记、2AL染色体

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S5 ;S85

国家自然科学基金项目31171839,31401385;山西省青年基金项目2015021145;山西省农业攻关项目20150311001-1,20150311001-5;山西省农业科学院攻关项目15YGG01;北京市农林科学院青年基金项目QNJJ201428资助。This study was supported by the National Natural Science Foundation of China31171839,31401385;Shanxi Province Science Foundation for Youths2015021145;Shanxi Province Technologies R&D Program20150311001-1,20150311001-5;the Technologies R&D Program of the Shanxi Academy of Agricultural Sciences15YGG01;the Youth Foundation of Beijing Academy of Agricultural and Forestry SciencesQNJJ201428

2016-06-22(万方平台首次上网日期,不代表论文的发表时间)

共8页

795-802

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作物学报

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