玉米响应渗透胁迫的数字基因表达谱分析

摘要：

以玉米种质POB21为材料,利用数字基因表达谱技术对15％ PEG渗透胁迫处理后的玉米叶片cDNA文库进行差异基因表达谱分析.结果表明,转录组基因序列与参考基因组高度一致,基因表达呈现出高度不均一性和部分冗余性.从中筛选出1097个有效差异表达基因,其中795个表达上调,302个表达下调.GO功能显著性富集分析表明,3种细胞组分和分子功能中的3种糖基转移酶活性表现为富集.KEGG代谢分析表明差异表达基因广泛涉及糖、蛋白、核酸和脂类等生物大分子代谢、次生代谢、激素代谢以及能量代谢过程.脯氨酸代谢相关基因的差异表达分析表明,谷氨酸途径是胁迫诱导脯氨酸积累的主要方式.表达谱分析结果为玉米渗透胁迫响应分子机制的深入研究和功能基因的筛选奠定了基础.

关键词：玉米、渗透胁迫、基因表达谱、差异表达基因

所属期刊栏目：40

分类号：S5 ;S51

资助基金：中国博士后科学基金2012M511053;国家转基因生物新品种培育重大专项2013ZX08011-006

在线出版日期：2014-09-03（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共10页

页码：1164-1173