普通菜豆基因组SSR标记开发及在豇豆和小豆中的通用性分析

摘要：

分子标记具种属间通用性可提高其利用效率,并降低标记开发成本.本研究基于Roche 454超高通量测序技术获得普通菜豆基因组测序结果,共开发了560个普通菜豆基因组SSR标记.利用2份普通菜豆品种对标记进行初步筛选,有421个标记能够有效扩增.用新开发的标记分析16份豇豆和16份小豆的通用性.结果显示,185个普通菜豆基因组SSR标记在豇豆中能有效扩增,通用性比率为43.9％; 161个SSR标记在小豆中能有效扩增,通用性比率为38.2％;在豇豆和小豆中都能获得有效扩增条带的标记共138个;并且普通菜豆基因序列SSR标记在豇豆和小豆中的通用性比率高于基因间序列SSR标记.通用性标记的多态性分析表明,豇豆和小豆的多态性比率分别为34.0％和24.8％;且豇豆和小豆中基因间标记的多态性都比基因内标记的多态性高.上述通用性标记为豇豆属作物的多样性评价、连锁图谱的构建及基因定位等方面的研究提供了便利.

关键词：普通菜豆、豇豆属、SSR标记、通用性

所属期刊栏目：40

分类号：S64;S52

资助基金：中国农业科学院科技创新工程和国家科技支撑计划项目2013BAD01B05-2-4

在线出版日期：2014-07-14（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共10页

页码：924-933