小豆遗传差异、群体结构和连锁不平衡水平的SSR分析

摘要：

利用57对小豆SSR标记和31对绿豆SSR标记,用5份日本材料作对照,对249份中国小豆种质进行遗传差异、群体结构和连锁不平衡(LD)分析.结果表明,共检测到630个等位变异,SSR位点等位变异数在2～17之间,遗传多样性指数范围为0.024～0.898,平均为0.574.15个不同地理来源群体间表现出显著的遗传多样性差异,其中中国云南最高,河北和天津最低.聚类分析将254份材料划分为3个类群,在一定程度上和地理生态环境相关.LD分析显示和其他作物相比,小豆LD衰减距离较短,最大衰减距离为5.8 cM (R2＞0.1),基因组LD平均衰减距离小于1 cM (R2＞0.1,P＜0.001).

关键词：小豆、SSR标记、遗传多样性、群体结构、连锁不平衡

所属期刊栏目：40

分类号：TE1;S51

资助基金：国家现代农业产业技术体系建设专项CARS-09;国家公益性行业农业科研专项经费nyhyzx07-017;作物种质资源保护NB2013-2130135-25-09;中国农业科学院科技创新工程资助

在线出版日期：2014-07-14（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共10页

页码：788-797