甜叶菊微卫星富集文库的构建与多态性标记的筛选

摘要：

甜叶菊是我国一种重要特种经济作物,其分子标记相关遗传背景研究甚少.本研究基于生物素与链霉亲和素的强亲和性原理,用链霉亲和素顺磁颗粒捕捉人工合成的标记有生物素的寡核苷酸探针(AG)15,间接筛选出含有甜叶菊基因组微卫星序列的DNA酶切片段,将筛选得到的片段连接到pUC-T载体中,构建甜叶菊微卫星序列的富集文库.挑取354个克隆进行菌落PCR检验,从中筛选出158个阳性克隆进行测序.结果表明,134个(84.81％)克隆中含有微卫星序列,其中完美型85个(63.43％)、非完美型15个(11.19％)、复合型34个(25.38％).根据微卫星序列共设计出71对微卫星引物,其中62对能扩增出稳定的条带.利用24个甜叶菊品系对这62对引物的遗传多样性的分析表明,有16个位点表现出多态性,等位基因数为2～8个,平均每个位点扩增得到4.5个等位基因,多态性信息含量在0.3163～0.7595之间,观测杂合度(Ho)与期望杂合度(He)的范围分别为0.2174～0.9167与0.3555～0.8076.通过聚类分析,将甜叶菊分为大小叶两大类.本研究开发出的微卫星标记可为甜叶菊的分子遗传育种提供有效的遗传标记.

关键词：甜叶菊、富集文库、微卫星、磁珠、遗传多样性

所属期刊栏目：40

分类号：S43;TQ4

资助基金：浙江省科技攻关项目2009C32030

在线出版日期：2014-07-10（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共10页

页码：447-456