烟草表达抗病基因同源物(RGA)的鉴定及RGA-SSR标记的开发
烟草是研究植物与病原菌互作的理想材料.鉴定烟草抗病基因及其同源物对揭示抗病机制具有重要意义.近年来公共数据库不断增长的EST序列为烟草表达RGA的鉴定提供丰富的数据.本研究通过拼接GenBank收录的412 325条烟草EST序列,获得149 606条Uni-EST序列.随后利用已克隆的112个植物R基因蛋白序列对其扫描,检测出1113个NtRGA,其中有273、546、53、102和30个分别包含NBS-LRR、LRR-PK、LRR、PK和Mlo结构域,另有109个未检测到结构域.通过序列比对将1071个NtRGA定位于N.benthamiana基因组712个位点上.经搜索,从72个NtRGA中检测出78个SSR,根据其侧翼序列设计64对引物.54对成功从烟草基因组DNA中扩增出清晰条带,9对在24个普通烟草品种间检测出多态性,检出等位基因数2~4个,平均2.56个;41对在6个烟草种间检测出多态性,检出等位基因数2~4个,平均2.61个.
烟草、表达序列标签、抗病基因同源物、SSR
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S43;TS4
广东省烟草专卖局科技计划项目201106;广东省科技计划项目2010B020302004;广东省烟草专卖局公司科技项目200905
2014-05-08(万方平台首次上网日期,不代表论文的发表时间)
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