宿根矮化病菌诱导甘蔗差异表达基因的cDNA-SCoT分析
宿根矮化病是危害严重的世界性甘蔗主要病害之一,为了探究甘蔗在该病胁迫下的抗病分子机制,本研究以甘蔗品种新台糖22健康植株为材料,利用含有宿根矮化病病原菌的蔗汁诱导其抗性,分别在接种后2、4、6、8和10 d取样,构建宿根矮化病侵染处理与对照的RNA混合池,利用cDNA-SCoT法进行差异显示研究.结果表明,80条SCoT引物扩增出500多条带,长度在100~1800 bp之间.从中筛选出30个差异明显的条带,测序后序列拼接,获得22条高质量的EST序列.生物信息学分析显示,对甘蔗宿根矮化病的差异基因主要涉及能量代谢、防卫反应、信号转导、蛋白质类代谢等方面.进一步基因功能分析显示,油菜素内酯合成蛋白、NBS-LRR类抗性蛋白、茉莉酸诱导蛋白、α-微管蛋白、ABA胁迫成熟蛋白、富含脯氨酸蛋白、翻译起始因子eif-2bα亚族等可能参与了甘蔗宿根矮化病病原菌互作的过程.
甘蔗、宿根矮化病、cDNA-SCoT、差异基因
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S56;S43
广西自然科学基金重点项目2012GXNSFDA053011;广西壮族自治区主席科技资金项目11166-02;科技部国际合作项目2008DFA30600,2009DFA30820和2013DFA31600;广西自然科学基金创新团队项目2011GXNSFF018002;广西农业科学院创新团队项目桂农科 2011YT01;广西自然科学基金重点项目2012GXNSFDA053;广西科学研究与技术开发计划项目桂科产 1123008-1和桂科能 0815011
2013-10-21(万方平台首次上网日期,不代表论文的发表时间)
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