干旱胁迫下油菜消减文库的构建及分析
以抗旱能力强的油菜Holiday为材料,以干旱处理的样品为Tester,正常水分管理(对照)为Driver构建干旱诱导的甘蓝型油菜叶片正向抑制性消减杂交(SSH)文库.随机挑选24个阳性克隆进行PCR验证,结果表明,其中23个含有插入片段,平均大小在750 bp左右.将96个阳性克隆测序,运用CAP3 Sequence Assembly Program聚类、拼接和去除冗余,获得重叠群4条,单拷贝序列82条,平均长度为542 bp.经BlastX程序比对蛋白数据库发现,11条EST没有找到同源性序列,75条有同源序列.KOBAS分析发现,28条EST被定位到67条代谢途径中,根据P值推测,光合中的碳固定、有氧呼吸的电子供体、氮代谢、乙醛酸和二羧酸代谢在植物干旱胁迫中发挥着极为重要的作用.这些EST涉及到的功能中所占比例最大的分别是细胞器(58.82％)、结合(30.77％)和新陈代谢过程(43.72％),表明甘蓝型油菜受到干旱胁迫时,细胞器组件上的功能发挥了重要的作用,结合基因和蛋白被激活,加强了新陈代谢.
油菜、抑制差减杂交、干旱胁迫、cDNA文库、表达序列标签
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R73;R38
中央高校基本科研业务费专项资金XDJK2009B020;重庆市自然科学基金项目CSTC2010BB1012
2013-08-15（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
共9页
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