芝麻种质资源SSR标记遗传多样性与群体结构分析

摘要：

利用42对具明显多态性的SSR引物,分析国内外545份芝麻品种的遗传多样性和群体结构.结果检测到106个等位变异位点,引物多态位点范围为3～9个,平均为3.8个/引物,Y1994引物的等位位点最多,为9个.引物Shannon's信息指数(I)范围为1.4834～0.1233,平均值为0.6450;多态信息指数(pIC)范围为0.7481～0.0516,平均值为0.4092,平均杂合度(He)为0.1162.UPGMA聚类、二元主成分及群体结构分析结果基本一致；供试545份芝麻资源可被分为3个UPGMA组群,在群体结构上分为3个亚群；芝麻资源整体遗传分化较小,亲缘关系较近.中国7个生态群种质相似系数范围为0.9811～0.5462,东北西北等区域资源与黄淮、江汉、华中华南等区的亲缘关系较远；国外7个生态群相似系数为0.9726～0.7442,非洲区与日本区种质亲缘关系较近,与中国资源亲缘关系较远.中国种质资源遗传基础较为狭窄,遗传多样性与地理分布不完全相关,而国外资源遗传多样性丰富.在今后芝麻育种工作中,应加强国外资源的引进与利用,并注重国内不同类群资源利用,拓宽我国芝麻品种遗传基础.

关键词：芝麻、种质资源、SSR标记、遗传多样性、群体结构

所属期刊栏目：38

分类号：S56;S81

资助基金：国家重点基础研究发展计划973计划项目2011CB109304;国家现代农业产业技术体系建设专项CARS-15

在线出版日期：2013-04-15（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共11页

页码：2286-2296