棉花S-腺苷甲硫氨酸脱羧酶基因的克隆及低温下的表达分析

摘要：

根据棉花S-腺苷甲硫氨酸脱羧酶(S-adenosylmethionine decarboxylase,SAMDC)基因已知EST序列设计引物,采用RACE和RT-PCR技术克隆获得该基因的全长cDNA序列,命名为GhSAMDC (GenBank登录号为JN020148).生物信息学分析表明,GhSAMDC cDNA序列全长1874 bp,涵盖tiny ORF (tORF)、upstream ORF (uORF)和main ORF(mORF)3个植物SAMDC基因特征ORF.其中mORF长1064 bp,编码含355个氨基酸残基的SAMDC酶原,预测分子量为38.25 kD,该酶原含有高度保守的酶原剪切位点结构域(LSESSLF)和与SAMDC蛋白快速降解有关的PEST(TIHVTPEDGFSYAS)结构域.GhSAMDC基因组DNA序列全长2743 bp,包含3个内含子,均位于5′UTR,其中一个位于uORF内.聚类分析表明,GhSAMDC与葡萄中该蛋白的同源关系最近,并且与其他双子叶植物聚为一类.荧光定量PCR分析结果表明,GhSAMDC表达受低温诱导,在冷敏感品种新陆早1号中基因表达水平明显高于在耐冷品种新陆早33中.

关键词：棉花、S-腺苷甲硫氨酸脱羧酶、序列分析、定量PCR、低温表达

所属期刊栏目：38

分类号：TQ9;TQ4

资助基金：兵团博士资金项目2011BB004;国家转基因生物新品种培育重大专项子课题2008ZX08005-005

在线出版日期：2013-01-08（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共8页

页码：1649-1656