大豆NF-YB家族全基因组鉴定、分类和表达

摘要：

利用大豆基因组数据库,通过生物信息学手段,鉴定大豆NF-YB家族基因的全序列、定位和拷贝数,通过序列比对进行进化和分类分析.利用大豆高通量RNA测序数据、NCBI中UniGene的EST表达数据进行组织表达谱分析.结果表明,大豆基因组中含有28个NF-YB家族基因,分布于大豆的14条染色体上,系统进化树分析将其分成3类.启动子分析表明,几乎全部NF-YB家族基因的启动子区均含有逆境应答反应顺式作用元件.各个发育阶段中,多数成员至少在一个组织中表达,10个差异表达的基因中有2个在根瘤中特异表达,2个在根中特异表达,2个在根瘤中优势表达,另外4个在其他部位优势表达.研究结果促进了NF-YB家族基因的功能研究与利用.

关键词：NF-YB家族、全基因组鉴定、进化、差异表达、启动子

所属期刊栏目：38

分类号：R39;TP3

资助基金：国家自然科学基金项目31171546;国家转基因生物新品种培育科技重大专项2011ZX08002-002,2009ZX08009-083B

在线出版日期：2013-01-08（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共13页

页码：1570-1582