利用SSCP技术分析甘蓝型油菜10个功能基因序列差异
以甘蓝型油菜SI-1300和Eagle为材料,利用DNA单链构象多态性(single-strand conformation polymorphism,SSCP)技术,对10对功能基因特异性引物进行多态性分析,每对引物均检测到1个多态性位点.随后随机挑选10个多态性片段进行测序,并利用bl2seq软件比较测序序列与基因原始序列.结果显示测序序列与所对应的基因原始序列之间相似程度平均高达98％,差异碱基数平均仅为2.3个.进一步选取5对引物比较分析两个材料间的差异扩增片 段序列,发现差异扩增片段在2个材料中高度保守,平均相似度达97％；在所测序的5对引物扩增序列中,共存在39个单核苷酸多态性(single-nucleotide polymorphisms,SNPs)和5个插入/缺失突变(insertion-deletions,INDELs),SNP和INDEL的发生频率分别为1 SNP/30 bp和1 INDEL/233 bp.结果表明,SSCP标记能够真实代表原始功能基因,甘蓝型油菜功能基因序列在不同材料间高度保守,其遗传变异类型主要来源于SNP.
甘蓝型油菜、功能基因、SSCP、序列分析
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S5 ;S63
山东省优秀中青年科学家科研奖励基金项目BS2009NY017;国家重点基础研究计划973计划项目2007CB 1090
2012-06-27（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
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