用生物信息学挖掘玉米中的microRNAs及其靶基因

摘要：

microRNA(miRNA)是一类内源性的、19～24碱基长度的小分子非编码RNA,通过碱基互补调控靶基因的表达,在多细胞生物的基因表达调控过程中扮演着十分重要的角色.植物中的miRNAs具有高度的保守性,这为通过同源比对发现保守的miRNAs提供了思路和途径.本研究通过对拟南芥、水稻等植物已知的miRNAs与玉米EST和GSS数据库的比对,并设置一系列严格的筛选标准,共筛选到23条新的玉米miRNAs;利用WMD 3在线植物miRNAs靶基因预测软件,对新发现的玉米miRNAs进行靶基因预测,总共预测到89个靶基因,进一步功能分析发现,这些靶基因参与玉米的生长发育、信号转导、转录调节、新陈代谢及逆境胁迫响应等调控过程.

关键词：microRNA(miRNA)、生物信息学、预测、靶基因、玉米

所属期刊栏目：36

分类号：R39;TP2

资助基金：国家自然科学基金项目30900901;教育部高等学校博士学科点专项科研基金项目20095103120002

在线出版日期：2010-12-03（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共12页

页码：1324-1335