大豆重组自交系群体NJRIKY遗传图谱的加密及其应用效果
作物基因组研究,包括基因或数量性状位点(QTL)定位、图位克隆以及物理图谱构建等,首先必须建立具有丰富标记信息的高密度遗传连锁图谱.由科丰1号和南农1138-2杂交组合衍生的重组自交系群体NJRIKY已经构建了4张大豆遗传连锁图谱,但由于遗传信息和标记数目不够充分.在基因和QTL作图时仍然存在精确度和准确度问题.为增加NJRIKY图谱密度,本研究在967对SSR引物中获得了401个多态性SSR标记.结合其他分子数据,使用作图软件Mapmaker/Exp 3.0b,获得一张含有553个遗传标记,25个连锁群,总长2 071.6 cM,平均图距3.70 cM的新遗传连锁图谱,其中SSR标记316个,RFLP标记197个,EST标记39个,形态标记1个.连锁群上大于20 cM的标记间隔由原来42个减少到2个.原图谱的3个SMV抗性基因定位于Dlb连锁群末端的开放区间上且仅与一个RFLP标记连锁,利用加密图谱对Rsc-3、Rsc-7、Rsc-9、Rsc-13、Rsα、Rn1和Rn3等7个SMV抗性基因重定位,全部位于D1b连锁群,与相邻分子标记距离均小于6 cM,其中Rsc-9、Rn1、Rsa的距离小于1 cM,Rsc-13与EST标记GMKF168a共分离.对本群体农艺性状进行QTL重定位,获得8个性状相关的42个主效QTL,其中20个QTL遗传贡献率大于10%,与原图谱比较,新定位的各QTL的标记区间明显缩短,与相邻标记的连锁更加紧密.
大豆、遗传连锁图谱、SSR标记、QTL
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S56;S51
国家重点基础研究发展计划973计划项目2006CB101708,2009CB118404;国家高新技术研究发展计划863计划项目2006AA100104;教育部高等学校创新引智计划项目B08025;农业部公益性行业专项200803060
2010-04-12（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
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