甘蔗中一个NBS-LRR类基因的全长克隆与表达分析
采用RACE技术,从甘蔗高抗黑穗病品种NCo376中克隆了一个NBS-LRR类基因的cDNA全长序列,命名为SNLR.生物信息学分析显示,甘蔗SNLR基因的cDNA全长为2 985 bp(GenBank登录号为EF155654),包括一个2 661 bp的完整开放读码框以及一个典型的29 bp poly-A.同时,还具有NBS-LRR类抗病基因的所有保守结构域,包括4个NBS区域保守结构域和6个潜在LRR结构域;蛋白疏水性分析和二级、三级结构分析表明,该基因编码的蛋白质为弱碱性蛋白,pI为7.76,无明显的疏水结构域,以卷曲结构和螺旋结构为骨架,三级结构未见明显的跨膜信号蛋白区.定量PCR分析表明,甘蔗SNLR基因的表达受到黑穗病菌、水杨酸和过氧化氢的影响,分别表现出"抑-扬"、"全程抑制"和"扬-抑"的表达模式,也具有抗病基因组成型和组织特异性表达的特点.推测甘蔗SNLR基因可能为抗病相关基因.
甘蔗、分子克隆、抗病基因、定量PCR
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S43;R71
国家高技术研究发展计划863计划项目2007AA100701;农业部引进国际先进农业科学技术计划948计划项目2006-G37;国家自然科学基金项目30170639;福建省科技厅国家科技项目备案F2007AA100701;现代农业产业技术体系建设专项资助
2009-07-01(万方平台首次上网日期,不代表论文的发表时间)
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