利用斑茅cDNA芯片研究甘蔗受黑穗病菌侵染后基因差异表达

摘要：

为了解甘蔗抗黑穗病的分子机制,利用斑茅干旱胁迫cDNA芯片检测了甘蔗受黑穗病菌胁迫后的基因差异表达.经杂交,在cDNA芯片的3 860个模板中,有效差异表达(Ratio值≥2.0或≤0.5)的基因为101个,其中上调55个,下调46个.部分基因的定量PCR验证表明,芯片杂交结果可靠.上调表达基因经测序、冗余序列剔除,一共获得36个unique ESTs.已知功能的22个上调表达基因,涉及多条生理代谢途径,如光合作用、离子转运和核酸代谢途径:以及多种分子水平的进程,如基因转录、蛋白质合成与修饰以及细胞信号转导等.另外,还检测到14个未知功能基因.结果表明,甘蔗对黑穗病的抗性具有复杂的机制.本研究为解释甘蔗受黑穗病菌胁迫后的基因差异表达及其网络构建奠定了基础,还为今后系统研究甘蔗对生物与非生物胁迫的响应机制提供技术支持.

关键词：甘蔗、黑穗病菌、斑茅、cDNA芯片、差异表达基因

所属期刊栏目：35

分类号：S56;S33

资助基金：国家高技术研究发展计划863计划项目2007AA100701;农业部引进国际先进农业科学技术计划948计划项目2006-G37;国家自然科学基金项目30170639;福建省科技厅国家科技项目备案F2007AA100701;现代农业产业技术体系建设专项资助

在线出版日期：2009-06-17（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共6页

页码：940-945