草棉EST-SSRs的遗传评价

摘要：

根据GenBank中公布的247条草棉EST序列,搜索SSR并进行引物设计.其中的25条序列含有27个SSR,1-6碱基重复类型都存在,二碱基和三碱基重复的频率较高.为了明确在A、D和AD基因组中的可转移性,依据25条序列共设计25对EST-SSR引物,其中22对引物扩增出清晰可辨的DNA条带,产生92个多态性片段,平均每对引物产生3.64个多态性片段.引物的多态性信息含量(PIC)在0.49～0.91之间,平均为0.81.6对引物在BC1种间作图群体[(鄂棉22×Pima3-79)×鄂棉22]中表现多态性,产生7个多态性位点,其中5个为共显性,2个为显性.除HAU230b标记在BC1分离群体中不符合孟德尔式分离比例,其余引物表现正常分离.6个位点被整合到陆地棉和海岛棉种间BC1遗传连锁图谱卜的6条染色体:有4个位于A亚基因组的4条染色体上(Chr.6、10、11和12),2个位于D亚基因组的2条染色体(Chr.19和20).

关键词：草棉、表达序列标签、简单序列重复、多态性信息含量、遗传作图

所属期刊栏目：34

分类号：S56;S85

资助基金：国家重点基础研究发展计划863计划项目2006AA102153,20060AA00105

在线出版日期：2009-03-06（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共7页

页码：2085-2091