中国栽培和野生大豆农艺品质性状与SSR标记的关联分析I.群体结构及关联标记
关联作图是一种利用连锁不平衡(linkage disequilibrium,LD)检测自然群体中基因位点及其等位变异的方法.利用60个SSR标记,对全国大豆地方品种群体(393份代表性材料)和野生大豆群体(196份代表性材料)的基因组变异进行扫描,分析两类群体的连锁不平衡位点、群体结构,并采用TASSEL软件的GLM(general linear model)方法对16个农艺、品质性状观测值进行标记与性状的关联分析.结果表明:(1)在公共图谱上不论共线性的或是非共线性的SSR位点组合都有一定程度的LD,说明历史上发生过连锁群间的重组;栽培群体的连锁不平衡成对位点数较野生群体多,但野生群体位点间连锁不平衡程度高,随距离的衰减慢.(2)群体SSR数据遗传结构分析发现,栽培群体和野生群体分别由9和4个亚群体组成,亚群的划分与群体地理生态类型相关联,证实地理生态类型划分有其遗传基础.(3)栽培群体中累计有27个位点与性状相关;野生大豆种质中累计有34个位点与性状相关.部分标记在两类群体中都表现与同一性状关联,检出的位点有一致性,也有互补性;一些标记同时与2个或多个性状相关联,可能是性状相关乃至一因多效的遗传基础;关联位点中累计有24位点(次)与遗传群体连锁分析定位的QTL一致.
栽培大豆[Glycine、max(L.)Merr]、野生大豆(Glycine、soja、Sieb、et、Zucc)、SSR、群体结构、关联分析
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S51;S7
国家重点基础研究发展计划973计划项目2004CB7206,2006CB101708;国家高技术研究发展计划863计划项目2006AA100104:国家科技支撑计划项目2006BAD13B05-7:国家自然科学基金项目30490250,32671266;教育部高等学校创新引智计划项目B08025;农业部公益性行业专项20080
2008-09-23（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
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