碰撞诱导解离和高能碰撞解离方式进行蛋白质组学分析的比较

摘要：

为了比较碰撞诱导解离(collision induced dissociation,CID)和高能碰撞解离(high energy collision dissociation,HCD)两种离子裂解模式在蛋白质组学分析方面的差异,分别应用这两种模式对牛血清白蛋白和细胞裂解物进行分析。通过比较所鉴定到的多肽和蛋白数目,发现在牛血清白蛋白中,HCD 碎裂方法所得的谱图匹配率和多肽 Mascot 得分均较高,表明其质谱图质量较好。在复杂样品细胞裂解物分析中,CID 碎裂方法鉴定到的谱图数、多肽数和蛋白数目均较多,表明该模式的灵敏度较高；HCD 碎裂方法所得的谱图匹配率和 Mascot 得分均较高,表明其质谱图质量较好。因此,这两种模式均可用于大规模蛋白质组学分析,CID 模式可提供更高的灵敏度,而 HCD 模式则可获得更高质量的质谱谱图。

关键词：质谱、碰撞诱导解离(CID)、高能碰撞解离(HCD)、蛋白质组学分析

所属期刊栏目：37

分类号：O657.63(分析化学)

资助基金：国家重点基础研究发展计划2013CB530805、2014CBA02005;中国科技部重点基础研究计划2013FY114100

在线出版日期：2016-04-27（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共7页

页码：140-146