蛋白质胰蛋白酶水解过程双位点漏切肽段的质谱鉴定

摘要：

为说明胰蛋白酶漏切位点数目设置对蛋白质搜库结果的影响,采用基质辅助激光解吸电离-串联飞行时间质谱(MALDI-TOF/TOF)高置信度地鉴定了细胞色素C和大豆脱落胁迫成熟蛋白.在细胞色素C和大豆脱落胁迫成熟蛋白的胰酶水解液中分别发现了2个和4个双胰酶漏切位点肽段,确认了文献中报道的当赖氨酸和赖氨酸相邻或赖氨酸、精氨酸各自与天冬氨酸或者谷氨酸相邻时,会引起胰蛋白酶的漏切.此外,还发现组氨酸-赖氨酸-异亮氨酸/丙氨酸结构也有此现象.本研究中检测出漏切肽段并没有明显提高序列覆盖率,但显著增加了蛋白质鉴定结果的确定性.在实际样品分析中如将漏切数设置为1有可能产生肽段鉴定的假阴性.

关键词：胰蛋白酶、基质辅助激光解吸电离-串联飞行时间质谱、细胞色素C、大豆脱落胁迫成熟蛋白

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分类号：O657.63(分析化学)

资助基金：国家自然科学基金31070731;深圳市科技研发资金科技条件平台计划重点实验室项目CXB201005240008A

在线出版日期：2013-05-06（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共6页

页码：29-34