根蘖与嫁接繁殖灵武长枣不同时期果实差异表达基因分析

摘要：

[目的]研究灵武长枣根蘖繁殖与嫁接繁殖果实品质差异的内在机理,为提高其果实品质提供基础数据.[方法]以灵武长枣根蘖繁殖与嫁接繁殖白熟期(NB)、着色期(NZ)、成熟期(NC)和嫁接繁殖白熟期(JB)、着色期(JZ)、成熟期(JC)的果实为试验材料,采用高通量测序技术进行果实转录组测序,筛选与根蘖和嫁接繁殖的灵武长枣果实品质差异相关的基因,初步探究根蘖和嫁接繁殖灵武长枣果实不同时期基因表达差异情况.[结果]18 个灵武长枣样品经过转录组测序,得到质控数据 138.26 GB,将其比对到参考基因组冬枣上,18 个样品的Cleans reads与参考基因组比对效率在 93.77%以上.主成分分析结果显示,3 次生物学重复样品聚集程度较高且组间存在分离现象,说明其基因表达量存在差异.差异分析结果表明,灵武长枣果实发育各时期组间分析对比中,果实白熟期(JB-vs-NB)、着色期(JZ-vs-NZ)和成熟期(JC-vs-NC)各组间分别筛选出65、4 509和1 534个差异基因.GO功能富集到生物过程、分子功能和细胞组分三大类中的50个亚类中,KEGG通路注释将差异基因显著富集在次生代谢物生物合成、代谢途径、氨基酸生物合成等通路中,成熟期差异基因富集在糖酸相关通路的显著性较高.[结论]在淀粉和蔗糖代谢、半乳糖代谢、氨基糖和核苷酸糖代谢,乙醛酸和二羧酸代谢、丁酸代谢 5 条与果实可溶性糖和总酸含量相关的代谢途径中筛选出了ncbi_107424266、ncbi_107414286、ncbi_107425230、ncbi_107429837 等 31 个差异基因,分别在果实发育不同时期的糖酸代谢途径中差异表达,调控各时期果实中可溶性糖及总酸含量.

关键词：灵武长枣、根蘖繁殖、嫁接繁殖、差异基因

所属期刊栏目：44

分类号：S727.3;S793.9(造林学、林木育种及造林技术)

资助基金：国家自然科学基金32060338

在线出版日期：2024-09-19（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共13页

页码：30-42