黑果枸杞果实发育过程中转录组测序分析

摘要：

[目的]研究黑果枸杞果实在不同发育阶段基因表达谱的变化情况,为进一步开展黑果枸杞果实发育过程中的分子生物学研究提供基础资料.[方法]以黑果枸杞果实发育过程中青果期、变色期和成熟期的果实为材料,利用新一代高通量测序技术平台Illumina Solexa进行转录组测序和数据de novo组装,并对得到的Unigene进行功能注释、分类及代谢通路分析.[结果]基于转录组测序数据得到N50值为1743 bp及平均长度为1262.65 bp的黑果枸杞Unigene共有43573条.在GO、KEGG、KOG、NR和SwissProt数据库上得到注释的Unigene总数为23723条,占总Unigene的54.44％,有3726条Unigene在这5个数据库中同时得以注释,但还有19850个Unigene在这些数据库中没有得到注释.23559条和17212条Unigene分别在Nr和SwissProt数据库有同源比对信息.GO数据库中注释到的15064个Unigene分为细胞组分、分子功能及生物学过程等3大类62个功能组.KOG数据库中注释到的13128个Unigene功能系统分为25类,其中黄酮类代谢途径所属的Q类(次生代谢产物生物合成、运输和代谢)共获得了520个Unigene注释.以KEGG数据库为参考,将4951个Unigene定位到215个代谢途径分支,其中有45个Unigene与类黄酮生物合成相关.在黑果枸杞果实转录组中发现16815个SSR位点:最多的为单核苷酸SSR,占72.92％;最少的是6核苷酸,占0.04％.[结论]共得到43573条Unigene,有23723条Unigene在GO、KEGG、KOG、NR和SwissProt 5个数据库中得以注释,筛选出与类黄酮生物合成有关的Unigene 45个,这为与黑果枸杞果实品质有关基因筛选、克隆和功能分析等提供研究基础和理论依据.

关键词：黑果枸杞、果实发育、转录组测序、功能注释

所属期刊栏目：40

分类号：S727.3(造林学、林木育种及造林技术)

资助基金：甘肃农业大学青年研究生指导教师扶持基金项目;甘肃农业大学科技创新项目林学一级学科建设开放基金;国家自然科学基金项目

在线出版日期：2020-09-25（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共9页

页码：147-155