泡桐高密度分子遗传图谱的构建

摘要：

以毛泡桐Paulownia tomentosa为母本、白花泡桐Paulownia fortunei为父本进行正反交,以杂交获得的子一代(F1)构建泡桐连锁图谱的作图群体,选取限制性内切酶EcoRI对185个样品的基因组进行酶切,利用Illumina Hiseq2000测序平台进行RAD测序建库,以白花泡桐基因组为参考,采用SOAP2软件进行序列比对,利用筛选到的单核苷酸多态性SNP(Single Nucleotide Polymorphisms,SNP)位点对该群体进行基因型分析,使用Joinmap version 4.0软件构建泡桐连锁遗传图谱.结果表明:利用RAD测序技术共获得551894个SNP标记,构建了含20个连锁群的泡桐遗传连锁图谱,该图谱的总图距为2050.77 cM,标记间平均图距为0.58 cM,图谱预期长度为2064.29 cM,图谱基因覆盖度为99.35％.本研究构建的泡桐连锁遗传图谱具有高精度和覆盖泡桐基因组完整(构建连锁群数目等于泡桐单倍体基因组染色体的数目)的优点,为泡桐分子育种学研究奠定了基础.

关键词：泡桐、遗传图谱、限制性酶切位点相关DNA测序、单核苷酸多态性

所属期刊栏目：39

分类号：S763.11(森林保护学)

资助基金：2012 年度河南省中原学者专项122101110700;河南省自然科学基金项目162300410158

在线出版日期：2019-09-12（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共6页

页码：80-85