金花茶异戊烯焦磷酸异构酶基因全长cDNA的克隆与生物信息学分析

摘要：

为深入研究金花茶花瓣类胡萝卜素合成的分子机理,在成功提取金花茶花瓣总RNA的基础上,利用同源克隆和RACE技术克隆得到了异戊烯焦磷酸异构酶基因的cDNA序列全长,命名为CnIPI.碱基序列分析表明:CnIPI基因全长916 bp,包含有一个长度为747 bp编码248个氨基酸的开发阅读框.生物信息学分析表明:该基因编码的CnIPI蛋白质分子量为27.97 kD,为稳定亲水性蛋白,无信号肽;CnIPI蛋白的二级结构以无规则卷曲为主,β-折叠所占比例最少;CnIPI蛋白含有一个典型的异戊烯焦磷酸异构酶结构域.氨基酸序列同源性分析结果表明:CnIPI蛋白与茶、月季、杜鹃等植物IPI蛋白的同源性高于86％.CnIPI基因的克隆使全面理解金花茶花瓣类胡萝卜素合成的分子途径取得了新的突破,为进一步深入研究CnIPI基因的功能及金花茶花瓣类胡萝卜素合成的分子机理奠定了良好的理论基础.

关键词：金花茶、异戊烯焦磷酸异构酶、基因克隆、序列分析

所属期刊栏目：39

分类号：S718.43(林业基础科学)

资助基金：国家自然科学基金项目31860228、31360197;河南省高校重点项目17B220002;河南省林木种质资源普查资助项目

在线出版日期：2019-09-12（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共5页

页码：75-79