珙桐DiCCoAOMT1基因的克隆及生物信息学分析

摘要：

种子休眠期长是导致珙桐自然繁殖力低下的重要原因之一.珙桐内果皮在发育后期快速木质化形成坚硬而致密的结构,可能是决定种子休眠时间的重要因素,而这一过程的调控机制尚不明确.本研究小组前期通过对珙桐内果皮发育的4个时期进行转录组测序,发现CCoAOMT基因家族与内果皮快速木质化关系密切.本研究从转录组中筛选到11个珙桐CCoAOMT基因家族基因,并利用生物信息学方法对筛选到的基因进行表达模式、序列特征、细胞定位和系统进化分析.分析显示,11个珙桐CCoAOMT基因根据表达模式可分为2种类型,筛选其中6个表达差异显著的CCoAOMT基因进一步分析其表达规律,最后确定其中差异表达最显著的Cluster-149.63013序列进行克隆及生物信息学分析.结果表明,该基因开放阅读框全长为744 bp,编码247个氨基酸,其氨基酸序列含有植物甲基化酶所共有的A、B、C基序及CCoAOMT蛋白特有的标志性序列D、E、F、G和H,其氨基酸序列与辣椒的CCoAOMT蛋白同源性最高,将其命名为DiCCoAOMT1.本研究克隆得到的DiCCoAOMT1基因可能是珙桐内果皮木质素快速积累的关键调控基因.

关键词：珙桐、CCoAOMT基因、木质素、种子休眠

所属期刊栏目：38

分类号：S718.46(林业基础科学)

资助基金：国家"十三五"重点研发计划项目2016YFD0600102;湖南省教育厅优秀青年项目17B282;湖南省研究生创新基金项目CX2016B332;中南林业科技大学研究生创新基金项目CX2016B21;中南林业科技大学青年科学研究基金项目QJ201512

在线出版日期：2018-08-24（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共7页

页码：96-102