樟叶越桔甘油醛-3-磷酸脱氢酶基因VdGAPDH1的cDNA克隆与序列分析

摘要：

应用转录组测序分析和RT-PCR技术首次从樟叶越桔Vaccinium dunalianum中克隆了全长1570 bp的甘油醛-3-磷酸脱氢酶基因VdGAPDH1，其完整的开放阅读框推测编码由337个氨基酸残基组成的VdGAPDH1。VdGAPDH1理论相对分子量为36.57 kD，等电点为7.06，负电荷残基（Asp+Glu）总数为42个，正电荷残基（Arg+Lys）总数为42个，不稳定系数为23.27，属稳定性蛋白质；其二级结构主要由随机卷曲、延伸链、α-螺旋和β-转角等构件组成。VdGAPDH1为无信号肽、无跨膜结构的亲水性蛋白质，推测其为NAD+-GAPDH的新成员，与已知细胞质型GAPDH之间存在高度保守性。VdGAPDH1包含2个保守超家族结构域Gp_dh_N和Gp_dh_C，Gp_dh_N为辅酶NAD+结合结构域，Gp_dh_C是行使糖运输和代谢的催化功能域。推测VdGAPDH1基因产物在樟叶越桔细胞质中参与糖酵解过程。该研究为后期VdGAPDH1基因的生理功能及其表达调控等研究奠定了基础。

关键词：樟叶越桔、甘油醛-3-磷酸脱氢酶、基因克隆、糖酵解

所属期刊栏目：36

分类号：S718.46(林业基础科学)

资助基金：国家自然科学基金;国家自然科学基金;云南省优势特色重点学科生物学一级学科建设项目

在线出版日期：2016-08-12（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共9页

页码：17-24,30