杜仲Ref基因密码子偏好性分析

摘要：

杜仲是世界上唯一的硬橡胶树种,是能够替代三叶橡胶的最具开发潜力的胶源植物.本研究以杜仲胶合成下游途径Ref基因为研究对象,运用CodonW和CUSPS等研究Ref基因的密码子组成特点及使用偏好性.研究结果表明,杜仲Ref基因的GC含量为49％,密码子第三位碱基的GC含量为59％;杜仲Ref基因有28个偏好使用的密码子,其中约60％(17个)的密码子以G/C结尾;与大肠杆菌、酵母、拟南芥和烟草的基因组密码子使用偏好性比较,杜仲与拟南芥基因组密码子的使用偏性更为接近,拟南芥更适合作为Ref转基因的受体.本研究为预测杜仲Ref基因的异源表达,适宜表达系统的选择以及Ref基因密码子的改造以提高其在宿主中的表达,进行有效的基因功能验证提供理论参考.

关键词：杜仲、Ref基因、密码子、偏好性

所属期刊栏目：36

分类号：S759.4(森林经营学、森林计测学、森林经理学)

资助基金：国家林业公益性行业科研专项201004029

在线出版日期：2016-07-12（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页码：8-12