银杏叶绿素a/b结合蛋白基因（GbLhcb4）及其启动子克隆

摘要：

为了探究银杏中叶绿素a/b结合蛋白基因（GbLhcb4）的结构及其相关的转录调控元件，基于Roche 454高通量测序获得的GbLhcb4基因片段，采用RACE技术分离得到该基因的cDNA序列，并通过染色体步移技术获得该基因启动子序列，结合生物信息学技术分析基因序列的特征、系统进化地位及启动子区域的转录调控元件。序列分析表明，GbLhcb4基因全长1200 bp，含有一个834 bp开放阅读框，编码277个氨基酸，相对分子量为30.65 kD，等电点为5.17。同源分析表明，该基因编码蛋白与北美云杉PsLhcb4蛋白（GenBank登录号：ABK21281.1）相似性最高，为74.7%。启动子顺式作用元件预测表明，启动子区域包含多个光响应元件及逆境响应元件，同时还存在激素响应、组织特异性表达、细胞周期等相关调控元件。此研究分离得到银杏GbLhcb4基因及启动子序列，并进行了相关的生物信息学分析，为探究银杏GbLhcb4基因应答环境信号的转录调控机制提供了分子基础。

关键词：银杏、叶绿素a/b结合蛋白基因、启动子分离、RACE技术

分类号：S792.95;Q786(森林树种)

资助基金：国家自然科学基金;江苏省自然基金;江苏省普通高等学校研究生科研创新计划;南京林业大学优秀博士学位论文创新基金

在线出版日期：2015-05-13（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共8页

页码：114-121