油桐烯脂酰CoA还原酶的克隆与表达模式分析

摘要：

以葡萄桐近成熟种子为材料，根据油桐转录组数据库中已知部分烯脂酰CoA还原酶(enoyl-CoA reductase, ECR)序列，利用RACE克隆技术，克隆得油桐烯脂酰CoA还原酶的全长cDNA序列，命名为VfECR，并对该基因的核苷酸序列及其相应氨基酸序列的理化性质、疏水性/亲水性、跨膜结构域、蛋白质的二、三级结构、亲缘关系进行分析。结果表明：该基因全长1154 bp，含有一个933 bp的开放阅读框，编码310个氨基酸，属于不稳定的亲水性蛋白，含有6个明显的跨膜结构域，且与陆地棉ECR蛋白的同源性最高，亲缘关系最为接近。同时利用RT-qPCR对VfECR基因的组织特异性和种子发育过程中的表达模式进行了分析，发现油桐VfECR基因主要在种仁中表达，在根、茎、叶等组织中表达量较少；在种子发育过程中，近成熟（8月、9月）到成熟种子（10月）中的表达量要明显高于未成熟种子（6月、7月）。

关键词：生物信息学、油桐、超长链脂肪酸、烯脂酰CoA还原酶、克隆技术、表达模式

分类号：S794.3;S603.2(森林树种)

资助基金：国家林业公益性行业科研专项重点项目201204403

在线出版日期：2014-11-28（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共9页

页码：9-17