大戟科Lhcb基因家族的全基因组鉴定、分类与进化分析

摘要：

基于已公布的基因组和EST数据,研究对蓖麻、麻疯树、木薯和橡胶树4种大戟科植物的Lhcb基因家族进行系统鉴定,并在此基础上分析其基因结构与进化关系.结果表明,蓖麻、麻疯树、木薯和橡胶树分别含有10、10、13和15个Lhcb基因,分属于Lhcb1、Lhcb2、Lhcb3、Lhcb4、Lhcb5、Lhcb6、Lhcb7和Lhcb8等8个亚家族,每个亚家族包含1～4个成员不等,基因的内含子数目在0～5个之间,部分基因还存在可变剪接形式.进化分析显示,Lhcb1、Lhcb4、Lhcb5和Lhcb7亚族早于单细胞的藻类中就已产生,Lhcb3和Lhcb6亚族在光合生物向陆地进化后产生,Lhcb2亚族存在于高等植物中,Lhcb8亚族则为双子叶植物所特有;Lhcb1亚族在所分析的4种大戟科植物中均出现了基因扩增,Lhcb2和Lhcb5亚族在木薯和橡胶树中出现了扩增,而Lhcb3和Lhcb6亚族仅在橡胶树中出现了扩增.

关键词：大戟科植物、全基因组、Lhcb基因家族、鉴定、分类、进化分析

所属期刊栏目：33

分类号：S718.46(林业基础科学)

资助基金：国家自然科学基金31100460,31100460;海南省重点科技项目90107;海南省自然科学基金312026;中国热带农业科学院橡胶研究所基本科研业务费专项1630022011014

在线出版日期：2014-02-26（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共7页

页码：46-52