杜仲果实和叶片转录组数据组装及基因功能注释

摘要：

所构建的杜仲果实和叶片转录组数据库获得了54 471 338条reads数据,包含4 902 420 420nt数据信息,对reads进行拼接,获得了452 421条Contig,总长度为90 705 736 nt;对contig进行拼接后,获得了147 027条Scaffold,总长度为65 877 052 nt;同理,对Scaffold进一步拼接后,获得了49 610条Unigene,总长度为37616 729 nt; Unigene和COG数据库进行比对表明,杜仲果实和叶片转录组中的Unigene根据功能大致可分为25类；杜仲果实和叶片转录组中的Unigene根据GO功能可分为生物过程、细胞组分和分子功能3大类42分支；以KEGG数据库为参考,依据代谢通路可以将转录组中的数据分成125类,包括脂类代谢,DNA剪切,植物激素生物合成,苯丙氨酸生物合成,萜类化合物与类固醇类化合物合成等.

关键词：杜仲、果实、叶片、转录组、基因功能

所属期刊栏目：32

分类号：S722.3;Q945(造林学、林木育种及造林技术)

资助基金：林业公益性行业科研专项;国家科技支撑计划

在线出版日期：2013-01-28（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共9页

页码：122-130