毛果杨WND1B基因启动子的克隆与缺失初步分析

摘要：

毛果杨Populus trichocarpa WND1B基因是拟南芥纤维细胞次生壁加厚中关键性调控因子SND1的同源基因.根据其序列进行BLAST分析,设计引物,用PCR方法克隆了WND1B起始密码子上游约2100 bp的5’调控序列.序列分析表明,该序列含典型的真核生物核心启动子区域,一些与真核生物典型的顺式调控元件相似的TATA-box、增强子元件、CAAT-box、GATA-box也存在于其中,此外还发现了一些与激素、低温胁迫诱导相关的顺式作用元件.分别设计引物,获得WND1B启动子的缺失序列.构建其表达载体pCAMBIA1301POG-1BP/1BP-F2/1 BP-F3/1BP-F4-GUS,并进行瞬时表达分析.GUS染色表明,PtrWND1BP/1BP-F3/1BP-F4序列具GUS活性,PtrWND1BP-F2序列不具有.这说明PtrWND1B 5’非编码区影响其启动子活性.

关键词：启动子、5’调控序列、克隆、生物信息学

所属期刊栏目：32

分类号：S731.2;S757.3(绿化建设)

资助基金：科技部863项目2009AA10Z101

在线出版日期：2012-08-07（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共6页

页码：164-169