油桐亲环素基因全长cDNA的克隆及序列分析

摘要：

亲环素基因广泛分布于各种生命体中,植物亲环素在植物生物学、胁迫应答、抗病原体免疫等方面起重要作用.根据油桐EST文库中的已知部分亲环素基因序列,通过5'RACE和RT-PCR,得到一个油桐亲环素全长cDNA序列.此基因全长为681 bp,包含一个长为519bp的完整CDS,编码172个氨基酸,将该基因命名为vf_cyp.生物信息学分析表明,该基因编码的蛋白质相对分子量18 038.5 Da,理论等电点8.68.通过预测分析表明该蛋白无跨膜结构,不存在信号肽切割位点,二级结构以β折叠和无规卷曲为主,分别占36.05％和52.91％,具有典型的肽脯氨酰顺反异构酶活性区及植物亲环素基因特有的7个氨基酸插入序列KS/MGKPLH,通过亲缘进化分析表明油桐亲环素氨基酸序列与橙、杂柑、毛果杨亲环素基因的氨基酸序列相似性分别达到94％、94％、93％.

关键词：油桐、亲环素、RACE、全长cDNA、序列分析

所属期刊栏目：31

分类号：S794.3(森林树种)

资助基金：林业公益性行业科研专项;林业公益性行业科研专项重点项目;湖南省自然科学基金

在线出版日期：2012-05-15（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共7页

页码：111-117