非洲菊CAD基因的密码子偏好性分析
[目的]研究非洲菊肉桂醇脱氢酶基因(Cinnamyl alcohol dehydrogenase,CAD)的密码子使用偏好性.[方法]从非洲菊转录组数据中筛选获得具有完整CDS的CAD基因,运用CodonW、EMBOSS、SPSS和Origin软件分析其密码子使用情况.[结论]筛选获得5条具有完整CDS的非洲菊CAD基因,其密码子偏好性较弱,编码氨基酸时倾向于使用较多的A或T.GC1s、GC2s、GC3s、GC和ENC之间无显著性的相关性.该基因编码氨基酸时除受突变压力的影响外,外界因素与自然压力影响较大.酵母菌真核表达系统适合作为异源表达系统,拟南芥则是较为理想的受体.[结论]该研究可为非洲菊CAD遗传转化研究奠定基础.
非洲菊、CAD基因、密码子偏好性、异源表达
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S682.11(观赏园艺(花卉和观赏树木))
福建省高原学科建设经费102/71201801101;福建农林大学科技创新专项基金项目CXZX2018082
2019-06-17(万方平台首次上网日期,不代表论文的发表时间)
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