基于Oncomine数据库及生物信息学方法挖掘FAM20C在宫颈癌中的表达及作用机制

摘要：

目的 通过深度挖掘Oncomine数据库中的基因信息,分析FAM20基因家族在宫颈癌中的表达及其作用机制.方法 通过Oncomine数据库查找有关于FAM20基因家族的研究信息,并对其在宫颈癌中的表达进行初步分析,根据分析结果,在Oncomine数据库中摘录所选取的FAM20家族成员在宫颈癌中的生存信息,使用GraphPad Prism软件进行生存分析,根据结果探讨其临床意义,发现FAM20基因家族中仅FAM20C基因对宫颈癌患者的生存率有意义,再使用TCGA数据库对FAM20C基因在宫颈癌中的表达及生存信息进行验证.用cBio-Portal分析FAM20C基因相关蛋白功能及途径富集,通过String构建FAM20C基因的相关蛋白网络图,分析蛋白富集的生理过程.结果 在Oncomine数据库中共收集33项FAM20家族成员在肿瘤组织及正常组织中表达差异的研究.对不同成员进一步分析发现,FAM20B、FAM20C在宫颈癌中的表达存在差异(P<0.05).对FAM20B及FAM20C基因在Oncomine数据库中的表达情况及生存数据做进一步分析,发现FAM20C高表达时患者生存率降低(P<0.05),与TCGA数据库所验证的结果大体相同.通过Genecards数据库收集到FAM20C相关蛋白DMP1、AMELX、AMBN、MEPE、ENAM、FGF23、AMTN、SPP1、AHSG,主要富集于牙齿及骨组织的发育调控、柱状上皮细胞的分化调控以及细胞黏附过程.结论 FAM20C基因可通过影响肿瘤细胞的迁移和侵袭,对宫颈癌患者的生存产生影响.同时,靶向FAM20C基因可能是宫颈癌潜在的诊断和治疗方法.

关键词：宫颈癌;FAM20基因家族;Oncomine数据库;计算生物学

所属期刊栏目：11

分类号：R737.33(肿瘤学)

在线出版日期：2021-11-22（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共7页

页码：570-576