生物信息学方法预测COL4A1在胃癌中的表达及临床预后意义

摘要：

目的 探索Ⅳ型胶原蛋白α1 (COL4A1)在胃癌中的表达水平及临床预后意义.方法 利用GEPIA、Oncomine、Kaplan-Meier Plotter等生物信息学在线分析网站,挖掘分析大型癌症公共数据TCGA及GEO中胃癌患者COL4A1的mRNA及蛋白表达信息,并采用Kaplan-Meier法进行生存分析,.进一步应用DAVID及String在线工具分析COL4A1的可能调控信号通路及构建蛋白互作网络.结果 GEPIA、Oncomine及Kaplan-Meier Plotter数据库(分别源于TCGA和GEO数据)分析结果显示,与正常对照组相比,COL4A1基因在胃癌中呈现明显高表达(P＜0.05).免疫组织化学检测结果显示,COL4A1蛋白在胃癌中亦呈高表达.Kaplan-Meier单因素生存分析结果显示,与低表达组相比,COL4A1高表达组胃癌患者的总生存时间显著减少(P＜0.05).DAVID网站富集分析结果显示,COL4A1在胃癌中的作用机制可能与ECM受体相互作用等通路有关.结论 COL4A1在胃癌组织中高表达,并与胃癌患者不良预后相关,未来可能成为胃癌治疗的潜在新靶点.

关键词：胃癌、Ⅳ型胶原蛋白α1、预后、生物信息学、免疫组化标记、信号通路富集

所属期刊栏目：9

分类号：R735.2;R34(肿瘤学)

在线出版日期：2019-10-31（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共7页

页码：626-631,652