10.3760/cma.j.cn115355-20220727-00484
胰腺癌组织中细胞分裂周期相关蛋白5的表达及其预后意义
目的:基于生物信息学方法分析胰腺癌组织中细胞分裂周期相关蛋白5(CDCA5)的表达及其与预后的相关性。方法:从癌症基因组图谱(TCGA)数据库中下载2021年1月至2021年12月168例胰腺癌样本RNA测序数据(HTSeq-FPKM)和相应的临床信息,从GEPIA2数据库中下载2021年1月至12月179例胰腺癌患者数据,同时整合TCGA和GTEx数据库中的171个正常胰腺组织样本。分析GEPIA2数据库中胰腺癌患者CDCA5 mRNA相对表达量及其与患者总生存(OS)和无病生存(DFS)的关系;结合患者临床资料,采用单因素和多因素Cox比例风险模型分析胰腺癌患者OS的影响因素;使用基因集富集分析(GSEA)探讨CDCA5在胰腺癌中可能参与的信号通路。结果:在GEPIA2数据库中,胰腺癌组织中CDCA5 mRNA相对表达量较正常胰腺组织升高,差异有统计学意义(
P<0.05)。根据CDCA5 mRNA相对表达量的中位值将胰腺癌患者分为高表达组(89例)和低表达组(89例)(等于中位值者未分组),CDCA5 mRNA高表达的胰腺癌患者较低表达患者OS(
P=0.024)和DFS差(
P=0.025)。TCGA数据库中,N分期(
HR=2.15,95%
CI 1.24~3.72,
P=0.006)和CDCA5(
HR=1.71,95%
CI 1.23~2.38,
P=0.001)表达为胰腺癌患者OS的独立影响因素。GSEA富集分析结果表明,CDCA5 mRNA高表达主要富集在13个生物学通路[均
P<0.05,错误发现率(FDR)<0.005],其中包括细胞周期、DNA复制、同源重组、嘧啶代谢、错配修复、磷酸戊糖途径、糖酵解糖异生和p53等信号通路。CDCA5 mRNA的表达与HK2、PKM、PGK1、ALDOA、EN01和LDHA的表达均呈正相关(均
P<0.05)。
结论:CDCA5在胰腺癌组织中高表达,且与患者预后不良有关,可以作为胰腺癌的预后标志物。
胰腺肿瘤、细胞分裂周期相关蛋白5、预后、基因集富集分析
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广西代谢性疾病研究重点实验室建设项目20-065-76;Guangxi Key Laboratory Construction Program of Metabolic Diseases Research20-065-76
2023-05-30(万方平台首次上网日期,不代表论文的发表时间)
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