10.3760/cma.j.cn115355-20210927-00439
四关节盒1基因在结直肠癌中的表达及其临床意义
目的:探讨四关节盒1(FJX1)基因在结直肠癌中的差异表达及其与预后的关系,以及相关作用机制。方法:于2021年7月16日,从癌症基因组图谱(TCGA)数据库下载结直肠癌的转录组数据以及临床资料,分析FJX1 mRNA在结直肠癌肿瘤组织和癌旁组织中的表达情况、FJX1 mRNA与患者临床病理特征和预后的关系;绘制受试者工作特征(ROC)曲线,评估FJX1 mRNA预测结直肠癌患者生存的价值;采用Cox比例风险模型评估FJX1 mRNA是否为结直肠癌独立的预后影响因素。从基因表达综合(GEO)数据库中下载结直肠癌患者总生存(OS)时间和生存状态,分析FJX1 mRNA与预后的关系。从加州大学圣克鲁斯分校(UCSC xena)数据库中下载结直肠癌的甲基化数据,确定FJX1 mRNA各位点的甲基化程度及FJX1 mRNA的表达水平与各位点甲基化程度的相关性。采用基因集合富集分析法(GSEA)(4.1.0)分析结直肠癌中与FJX1 mRNA相关的信号通路。利用肿瘤免疫评估资源(TIMER)数据库研究FJX1 mRNA与肿瘤浸润免疫细胞的相关性。采用Spearman分析与小分子/药物敏感性分析探讨FJX1 mRNA表达水平与药物敏感性的相关性。结果:TCGA数据库612例结直肠癌的转录组数据中,FJX1 mRNA在肿瘤组织中较癌旁组织高表达(
P<0.001);549例有完整资料结直肠癌患者FJX1 mRNA表达与M分期(
P=0.007)、病理分期(Ⅳ期比Ⅰ期,
P=0.016;Ⅳ期比Ⅱ期,
P=0.03;Ⅳ期比Ⅲ期,
P=0.012)相关,与年龄、性别、T分期、N分期均无关(均
P>0.05)。TCGA数据库和GEO数据库中,按照FJX1 mRNA表达量的中位值将患者分为高表达组和低表达组,FJX1 mRNA高表达组OS均较低表达组差(均
P<0.05)。利用TCGA数据库中数据绘制FJX1 mRNA表达对结直肠癌患者1、3、5年OS率的ROC曲线,曲线下面积(AUC)分别为0.595、0.625、0.764。多因素Cox回归分析结果显示年龄(
HR=1.050,95%
CI 1.028~1.073,
P<0.001)、T分期(
HR=1.787,95%
CI 1.090~2.927,
P=0.021)和FJX1 mRNA高表达(
HR=1.160,95%
CI 1.049~1.282,
P=0.004)是结直肠癌OS较差的独立影响因素。基因集合富集分析发现FJX1 mRNA与结直肠癌、TGF-β信号通路、VEGF信号通路、Wnt信号通路等有关。结肠癌中FJX1 mRNA的表达与FJX1 mRNA的甲基化程度呈负相关(
r=-0.16,
P<0.001),直肠癌中FJX1 mRNA的表达与FJX1 mRNA的甲基化程度呈正相关(
r=0.33,
P<0.001)。FJX1 mRNA表达量与静息记忆CD4
+ T细胞、M0型巨噬细胞、静息树突细胞浸润有关。FJX1 mRNA与甲氨蝶呤、5-氟尿嘧啶、吉非替尼等多种化疗药物和肿瘤靶向药物的耐药显著相关。
结论:FJX1 mRNA可能是结直肠癌潜在的生物标志物,且与免疫细胞浸润有关。
结直肠肿瘤、计算生物学、肿瘤微环境、预后、四关节盒1
34
山西省青年科技研究基金201901D211480;Shanxi Provincial Science and Technology Research Fund for Youths201901D211480
2023-05-30(万方平台首次上网日期,不代表论文的发表时间)
共7页
241-247