基于生物信息学分析结肠腺癌中胶原三股螺旋重复蛋白1基因表达的意义

摘要：

目的:基于生物信息学探讨结肠腺癌中胶原三股螺旋重复蛋白1（CTHRC1）基因表达的意义。方法:采用GEPIA2分析工具分析癌症基因组图谱（TCGA）数据库和GTEx数据库中结肠腺癌CTHRC1基因的表达及其与患者生存预后之间的关系；采用ULACAN分析工具分析TCGA数据库中CTHRC1基因在结肠腺癌组织和正常结肠组织中的甲基化水平。采用cBioportal网络分析工具分析CTHRC1基因突变。采用TIMER分析工具分析基因表达与免疫细胞浸润、肿瘤相关成纤维细胞浸润以及功能性免疫细胞之间的关系。采用STRING数据库分析与CTHRC1相互作用的蛋白，并进行富集分析。结果:在结肠腺癌组织中，CTHRC1基因和蛋白的表达水平均高于正常结肠组织，差异均有统计学意义（均
P<0.01），且CTHRC1基因在正常结肠组织中呈现高甲基化水平，在肿瘤组织中为低甲基化水平（
P<0.01）。2 480份结直肠腺癌和结肠腺癌样本中共检出19例突变，其中结肠腺癌标本CTHRC1突变3例，突变位点为R235H、A124V和R193C，突变类型均为错义突变。CTHRC1基因表达与CD8
+ T细胞、CD4
+ T细胞、巨噬细胞、中性粒细胞、树突细胞、肿瘤相关成纤维细胞浸润均呈正相关（均
P<0.01）。CTHRC1基因高表达患者的总生存、无病生存均差于CTHRC1基因低表达患者（均
P<0.05）。
结论:CTHRC1基因甲基化、肿瘤相关免疫细胞的浸润可能在结肠腺癌的发病过程中具有重要意义，CTHRC1基因表达和免疫细胞浸润可以作为结肠腺癌患者生存预后的预测指标。

关键词：结肠肿瘤、腺癌、计算生物学、胶原三股螺旋重复蛋白1

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资助基金：湖北省自然科学基金2016CFB154;十堰市科学技术研究与开发项目18Y27;Natural Science Foundation of Hubei Province2016CFB154;Science and Technology Research and Development Project of Shiyan18Y27

在线出版日期：2023-05-30（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共6页

页码：824-829