miR-497抑制结肠癌细胞HCT116炎症相关基因表达的基因芯片研究

摘要：

目的：采用基因芯片分析miR-497高表达对结肠癌细胞HCT116基因表达谱的影响。方法利用慢病毒感染人结肠癌细胞株 HCT116，建立 miR-497稳定高表达的结肠癌细胞模型HCT116-497细胞及阴性对照HCT116-CON细胞，用全基因组表达谱芯片筛选差异表达基因，利用MAS 3.0生物信息注释系统进行基因本体（gene ontology，GO）和信号通路富集分析（pathway analysis），筛选炎症相关基因。应用实时定量反转录聚合酶链反应（qRT-PCR）对候选基因进行验证。结果筛选出绝对倍数变化（absolute fold change）3.0倍以上的下调基因582个，发现其主要富集于炎症相关细胞因子网络等信号通路。选取下调基因中参与细胞因子网络和MAPK信号通路的15个炎症相关基因进行PCR验证后显示，与 HCT116-CON 细胞相比，HCT116-497细胞中10个基因（CACNB1、FOS、IL-29、RPS6KA2、TNFSF15、IL-11、INHBC、CSF1R、JAK3和IL-2Rβ）表达水平降低，差异均有统计学意义（均P＜0.05），与芯片结果一致。结论 miR-497抑制结肠癌细胞HCT116中炎症相关基因mRNA的表达。

关键词：miR-497、结肠肿瘤、炎症相关基因、基因本体、信号通路富集分析

所属期刊栏目：29

分类号：R73;R54

资助基金：国家自然科学基金81472837；山西省自然科学基金2013011043-3；山西省回国留学人员科研资助项目2013-133

在线出版日期：2017-03-17（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共6页

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