基于内质网应激相关基因的鼻咽癌预后模型的构建与验证

摘要：

[目的]探究内质网应激(endoplasmic reticulum stress,ERS)相关基因对鼻咽癌(nasopharynx cancer,NPC)患者生存预测价值,构建基于ERS相关基因的NPC预后模型.[方法]从MsigDB和Genecards数据库中筛选ERS相关基因,并纳入到单因素Cox回归和LASSO回归,构建基于相关基因的NPC预后相关的风险评分模型,并用外部数据集进行验证.此外,纳入临床数据和风险评分构建列线图模型,探索风险评分与免疫治疗反应之间的关系.最后,通过qRT-PCR探索NPC特征基因的表达情况和功能.[结果]经分析获得1 631个ERS相关基因,其中167个ERS相关基因在鼻咽组织中差异表达,上调26个,下调141个.筛选出5个具有统计学差异的基因,其中SPAG8、P4HTM、MLF1、GOLGA2在NPC组织内表达水平低于正常鼻咽组织,而GADD45A在NPC组织内表达水平高于正常鼻咽组织.基于这5个ERS相关基因构建风险评分模型.风险评分=(1.597×GADD45A+1.202×SPAG8+1.309×P4HTM+1.47×MLF1-1.586×GOLGA2).风险评分模型预测 1～3 年生存率受试者工作特征曲线,曲线下面积分别为0.756 9,0.809 3和0.718 7.高风险组B记忆细胞显著性低于低风险组(P＜0.001),而树突状细胞浸润比例显著性高于低风险组(P＜0.05).qRT-PCR验证4种ERS相关基因(SPAG8、P4HTM、MLF1、GOLGA2)在NPC组织中的表达水平均低于癌旁组织(P＜0.05),1种ERS相关基因(GADD45A)在NPC组织中的表达水平高于癌旁组织(P＜0.01).[结论]基于GEO数据库构建5个ERS相关基因组成的风险评分模型,列线图模型均能较准确地预测NPC患者预后,对NPC预后评估以及高风险群体筛杳具有一定的参考价值,对NPC患者免疫治疗有一定的指导价值.

关键词：鼻咽癌、内质网应激、风险评分模型、免疫疗法

所属期刊栏目：29

分类号：R739.63(肿瘤学)

资助基金：贵州省科技计划项目

在线出版日期：2023-11-07（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共10页

页码：767-776