差异甲基化区域与肺腺癌发生发展的关系

摘要：

[目的]探讨差异化甲基区域与肺腺癌发生发展的关系.[方法]收集新疆医科大学附属肿瘤医院2019年1-12月肺腺癌患者及健康对照组外周血各4例,采用Illumina高通量测序平台和850K芯片甲基化检测平台分别检测8例外周血基因谱数据,并以P＜0.05为标准筛选差异表达基因(differentially expressed genes,DEGs)及差异甲基化区域,进一步行DNA甲基化-基因表达联合分析得到目的基因.[结果]筛选出1 111个有意义的DEGs;针对DEGs各个区段甲基化的情况,筛选出4 519个差异甲基化基因,对比各组DNA甲基化和组间差异表达的全部基因,筛选出显著性差异表达基因和差异甲基化的基因,筛选得到6个目的基因,即CCR7、CD27、DSC1、LEF1-AS1、SLC8A1和LRRN3.GO功能分析显示差异甲基化区域在生物学途径、细胞成分和分子功能等方面密切相关.在GO功能和KEGG通路中,肺癌发生可能涉及CCL19和CCL21信号通路、缝隙连接、桥粒等分子机制,以及参与cGMP·PKG信号通路及钙离子信号通路等相关通路.[结论]CCR7、CD27、DSC1等甲基化的状态以及NFKB1-CCR7、STAT3-DSC1、SP1-CCR7等转录因子-基因表达调控网络可能参与肺癌的发生发展;差异甲基化区域在JNK通路及钙离子等信号通路中发挥着重要作用.

关键词：肺腺癌、DNA甲基化、基因表达、生物信息学

所属期刊栏目：28

分类号：R734.2(肿瘤学)

资助基金：国家自然科学基金;新疆自治区科技支疆项目

在线出版日期：2022-09-20（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共5页

页码：574-578