肿瘤相关hsa-miR-95-3p的靶基因预测及生物信息学分析

摘要：

[目的]对肿瘤相关hsa-miR-95-3p进行靶基因的预测及功能分析,为肿瘤发生的分子机制提供理论依据.[方法]选择miranda、TargetScan、RNAhybrid3种软件预测其靶基因,选择已经实验证实的靶基因作为进一步生物信息学分析的基因集合,对此基因集合进行功能富集分析(GO分析)、Pathway分析和蛋白互作分析.[结果]Hsa-miR-95-3p序列在各物种间高度保守.3个软件分别预测得到2118、1632和58个靶基因,鉴定得到实验验证的靶基因共114个,对这些靶基因进行GO和KEGG富集分析.这些靶基因主要富集于蛋白激酶反应、基因表达调控、细胞内信号传导、细胞分裂等生物学过程和功能上(P＜0.05).信号通路富集分析显示富集于AMPK信号通路,mTOR信号通路,p53信号通路,核黄素代谢,肝细胞癌,非小细胞肺癌,甲状腺癌,RNA降解等通路(P＜0.05).[结论]Hsa-miR-95-3p的靶基因主要与肿瘤细胞的增殖与分化即癌症发生的生物学过程相关,这为进一步实验研究提供了线索.

关键词：hsa-miR-95-3p、肿瘤、生物信息学、靶基因

所属期刊栏目：22

分类号：R73-3(肿瘤学)

资助基金：浙江中医药管理局一般项目2016ZB026

在线出版日期：2016-08-02（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页码：374-379