食管癌高表达抗原HLA-A2/A3限制性细胞毒性T淋巴细胞表位预测

摘要：

目的 预测食管癌普遍高表达蛋白COX-2和MAGE-4的HLA-A2/A3限制性CTL表位.方法 运用生物信息学的方法,SYFPEITHI初步预测,结合三维构效定量关系和蛋白酶体酶切位点分析.结果 对SYFPEITHI预测＞20的九肽用MHCPred和NetChop3.0作进一步分析,并与已报道抗原肽进行比对,初步筛选出了42个潜在的CTL表位.结论 这42个九肽均未见文献报道,进一步鉴定将为CTL表位疫苗的研究提供更多的线索.其中,MAGE- 422-30、202-210、286-294及COX-2479-487 4个九肽具有与HLA-A2和HLA-A3超型潜在的交叉免疫活性,将为研制简约的高效广谱食管癌疫苗提供候选肽.

关键词：食管癌、HLA、环氧合酶-2、MAGA-4、CTL表位

所属期刊栏目：34

分类号：R735.1(肿瘤学)

资助基金：河南省医学科技人才创新工程项目200311201

在线出版日期：2007-07-23（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共4页

页码：412-415