骨形态发生蛋白9调节乳腺癌细胞中长链非编码RNA的表达

摘要：

目的:筛选出与骨形态发生蛋白9(bone morphogenetic protein-9,BMP-9)表达相关的长链非编码RNA(long non-coding RNA,LncRNA),为探讨BMP-9通过调节LncRNA表达水平参与乳腺癌细胞生长、分化、迁移和凋亡等的作用机制提供实验依据.方法:将携带有BMP-9全基因的重组腺病毒Ad-BMP-9和携带有绿色荧光蛋白(green fluorescent protein,GFP)基因的空载体腺病毒Ad-GFP(对照组)分别感染MDA-MB-231细胞.应用微阵列芯片技术分别检测BMP-9过表达组(MDA-MB-231/BMP-9细胞)和对照组(MDA-MB-231/GFP细胞)中LncRNA表达谱的差异,并通过实时荧光定量PCR法验证筛选获得的14条LncRNA (LINC00443、LINC00638、LINC00486、RHNO1、SERHL、HOXA11-AS、IQCA1、LINC00461、LOC440173、LHFPL、ANKRD36BP2、BVES-AS1、LINC00937和LINC00608)在MDA-MB-231/BMP-9和MDA-MB-231/GFP细胞中的表达情况.通过基因本体论(gene ontology,GO)和京都基因与基因组百科全书(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes,KEGG)分析发生表达水平变化的LncRNA涉及的功能及通路.结果:重组BMP-9腺病毒感染的MDA-MB-231细胞中BMP-9 mRNA的表达水平较对照组明显升高.与对照组相比,BMP-9过表达的MDA-MB-231/BMP-9细胞中LncRNA表达水平发生明显变化.实时荧光定量PCR检测结果显示,LINC00443、LINC00638和LINC00486的表达水平上调(P值均＜ 0.05),IQ.CA1、LINC00461、LOC440173、LHFPL和ANKRD36BP2的表达水平下调(P值均＜ 0.05).发生表达改变的LncRNA参与了细胞骨架和细胞膜等的形成,或作为细胞间信号转导的信号分子发挥作用.结论:BMP-9过表达的MDA-MB-231细胞中LncRNA表达谱较对照组出现显著变化,提示部分LncRNA可能参与了BMP-9调控乳腺癌MDA-MB-231细胞增殖和侵袭等生物学过程,并发挥关键作用.

关键词：乳腺肿瘤、RNA、长链非编码、芯片分析技术、计算生物学

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分类号：R737.9(肿瘤学)

资助基金：1.重庆市科卫联合医学科研资助项目编号:2018MSXM0202.重庆市永川区自然科学基金资助项目Ycstc,2016nc5010

在线出版日期：2019-03-13（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共11页

页码：19-29