非编码长链RNA LOC100130476在食管鳞癌中的表达及其甲基化状态

摘要：

目的:检测人食管癌细胞系及食管鳞状细胞癌(esophageal squamous cell carcinoma,ESCC)组织中长链非编码RNA (long non-coding RNA,lncRNA) LOC100130476的表达情况及其甲基化状态,并探讨lncRNALOC100130476在食管鳞癌发生及发展中的作用.方法:分别应用RT-PCR以及甲基化特异性PCR(methylation specific PCR,MSP)法检测DNA甲基化转移酶抑制剂5-氮杂-2”-脱氧胞苷(5-aza-2”-deoxycytidine,5-Aza-dC)处理前后的食管癌细胞系TE1、TE13、T.TN和Ec109细胞中以及食管鳞癌组织及其相应癌旁正常组织中lncRNA LOC100130476的表达情况和甲基化状态.结果:未经5-Aza-dC处理的食管癌TE1、TE13和T.TN细胞中lncRNALOC100130476的表达均为阴性,仅在Ec109细胞中为弱阳性表达;用5-Aza-dC处理后,TE1、TE13和T.TN细胞中lncRNA LOC100130476均转变为阳性表达,而Ec109细胞中lncRNA LOC100130476的表达水平也有所上调.TE1、TE13、TTN和Ec109细胞中,在5-Aza-dC未处理前lncRNA LOC100130476均表现为高甲基化的状态,应用5-Aza-dC处理后,Ec109细胞中lncRNA LOC100130476甲基化程度明显降低,TE1、TE13和T.TN细胞中的lncRNALOC100130476则均表现为非甲基化状态.LncRNA LOC100130476在食管鳞癌组织中的表达水平为0.49±0.09,明显低于癌旁正常组织的0.56±0.08 (P＜0.05),并与组织分化程度和TNM分期密切相关(P值均＜ 0.05).食管鳞癌组织中lncRNA LOC100130476第一外显子区的甲基化率为69.44％ (50/72),明显高于癌旁正常组织的26.39％ (19/72) (P＜0.05),并与组织分化程度和TNM分期密切相关(P值均＜ 0.05).发生lncRNA LOC100130476甲基化的食管鳞癌组织中lncRNA LOC100130476的表达量为0.47±0.08,明显低于未发生甲基化的食管鳞癌组织的0.55±0.08 (P＜0.05).结论:LncRNA LOC100130476在食管鳞癌中的异常低表达与食管鳞癌的发生和发展密切相关,其第一外显子区的甲基化可能是导致其表达沉默的机制之一.

关键词：食管肿瘤、长链非编码RNA、DNA甲基化

所属期刊栏目：35

分类号：R735.1(肿瘤学)

资助基金：1.国家自然科学基金项目编号:81472335;2.河北省自然科学基金编号:H2015206196;1.National Natural Science Foundation of China No.81472335;2.Natural Science Foundation of Hebei Province No.H2015206196

在线出版日期：2015-09-18（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页码：866-873