胃癌转移相关miRNA的筛选及生物信息学分析

摘要：

目的:筛选与胃癌转移相关的微小RNA(microRNA,miRNA,miR),并进行生物信息学分析.方法:应用miRNA芯片对胃癌低转移细胞株(RF-1和MKN28)和高转移细胞株(RF-48、NCI-N87和KATO Ⅲ)进行miRNA差异表达谱分析,筛选差异表达的miRNA;应用实时荧光定量-PCR法对差异表达的miR-192、miR-215和miR-194进行验证,应用miRfocus在线数据库对筛选获得的miR-192、miR-193a、miR-194和miR-215进行靶基因预测及其信号转导通路进行分析.结果:与低转移细胞株比较,高转移细胞株中miR-192、miR-193a、miR-194和miR-215的表达水平明显上调,miR-105、miR-767、miR-149、miR-205、miR-30a、miR-30d、miR-365、miR-193b、miR-326、miR-100、miR-30b、miR-125b和miR-584的表达水平明显下调.实时荧光定量-PCR法对miR-192、miR-215和miR-194的表达进行验证,结果显示与miRNA芯片检测结果一致;生物信息学分析结果显示,miR-192、miR-193a、miR-194和miR-215及其靶基因参与肿瘤的发生、转移、细胞周期及范可尼贫血等通路.结论:胃癌高转移细胞中miR-192、miR-193a、miR-194和miR-215的上调可能与胃癌的发生和转移等有关.

关键词：胃肿瘤、微RNAs、微阵列分析、肿瘤转移、计算生物学

所属期刊栏目：34

分类号：R735.2(肿瘤学)

在线出版日期：2014-07-31（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页码：507-513