结直肠癌中lincRNAs表达特征的初步研究

摘要：

目的:探讨结直肠癌中长链基因间非编码RNAs(long intergenic non-coding RNAs,lincRNAs)的表达特征.方法:采用基因芯片技术检测4例结直肠癌及癌旁正常黏膜组织中长链非编码RNAs (long non-coding RNAs,IncRNAs)与mRNAs的表达情况,筛选出差异表达的lincRNAs与mRNAs并用MeV 4.6软件行聚类分析;进一步采用上海伯豪生物技术有限公司的生物芯片分析系统(SBC Analysis System,SAS)分析其相关信号转导通路;采用实时荧光定量-PCR方法验证linc-UCC、linc-DCC与MIR143HG在癌组织及癌旁组织中的表达情况,并分析与结直肠癌临床特征之间的相关性.结果:采用基因芯片共检测到42 545个RNA,其中124个lincRNAs和1 583个mRNAs的表达有明显差异.生物信息学分析结果显示,有29条信号转导通路可能与这些lincRNAs有关.linc-UCC在较多结直肠癌组织中表达增多,其高表达与肿瘤淋巴结转移密切相关;而linc-DCC与MIR143HG在多数结直肠癌组织中表达减少,二者呈正相关性.结论:通过基因芯片技术筛选获得与结直肠癌相关的lincRNAs,以期为结直肠癌的临床诊断及治疗提供一些新的靶点.

关键词：结直肠肿瘤、长链非编码RNA、芯片分析技术、系统生物学

所属期刊栏目：34

分类号：R735.34(肿瘤学)

资助基金：1.广东省自然科学基金8151008901000139;2.广州市科技计划项目2009Y-C011-1

在线出版日期：2014-05-04（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共8页

页码：245-252