cDNA芯片检测STAT5诱骗核苷酸对K562细胞凋亡相关基因的影响

摘要：

目的:转录因子STAT5在慢性粒细胞白血病(chronic myeloid leukemia,CML)中组成性激活,并与CML细胞恶性表型密切相关,本研究用cDNA芯片检测方法探讨诱骗核苷酸(decoy ODNs)抑制STAT5对白血病K562细胞株凋亡相关基因的影响.方法:分别提取decoy ODNs处理前后的K562细胞总RNA,逆转录合成Cy3、Cy5标记的cDNA探针,与人14K基因表达谱cDNA芯片(V2.0)杂交,扫描获得数据后,用Genespring软件分析对照组和实验组的差异表达基因,半定量RT-PCR验证cDNA芯片结果.结果:2张cDNA芯片检测重复性良好(R=0.9799).在13 824个标记的基因中,检出413个上调基因,其中包括:TIAF1、GAB1、GYPA、DAPK3、TNFRSF1B、IRF1和PML等在内的18个凋亡相关基因;在检出的332个下调基因中,发现PIM1、CCND2、CCND1、MYC和BCL2L1等在内的11个凋亡相关基因;部分基因经半定量RT-PCR证实与cDNA芯片结果一致.结论:Decoy ODNs抑制STAT5信号通路后可引起K562细胞多种凋亡相关基因的变化,本实验为进一步研究STAT5信号通路所调控的凋亡相关基因提供了依据.

关键词：白血病、髓样、慢性、信号转导和转录活化因子、诱骗脱氧寡核苷酸、细胞凋亡、寡核苷类排列序列分析、K562细胞

所属期刊栏目：26

分类号：R577.1;R733.72(消化系及腹部疾病)

资助基金：国家自然科学基金30270574

在线出版日期：2006-09-25（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共5页

页码：738-742